西大路四条交差点から東、四条通の地下と地上に存在する嵐電と阪急の駅です。
地上に嵐電の駅、地下に阪急の駅が存在するような構造で、上下線とも阪急と嵐電で概ね同位置に出入口があります。ただし嵐電は乗車の改札がなく均一運賃の降車時精算ですので阪急の改札口は通らずそれぞれの通路で直接ホームに上がります。

阪急の西院駅は「さいいんえき」ですが、嵐電の西院駅は「さいえき」と読み方が異なります。
西院はかつて平安京の右京四条二坊(現在の京都市右京区)にあった淳和天皇の離宮・後院「淳和院」(じゅんないん)の別名「西院」に由来します。元々は「さいいん」または「さいゐん」と読まれたようですが、時を経て「さゐ」の略称(?)が登場し、これが訛って「さい」に変じたとする説があります。明治に入り一帯に京都府葛野郡西院村が設置され、この村名は「さいいんむら」と読まれました。
変遷を経ながらも現在では概ね「さいいん」と読まれるようになりますが、嵐電は「さい」の読みを採用しています。