開業当初は嵯峨野駅でしたが、嵯峨野は嵐山を含むこの周辺一帯の名であり、土地勘のない観光客に誤解を与えることとなったため、1975(昭和50)年8月9日に有栖川駅に改称しています。有栖川は当駅と西となりの車折神社駅との間を通る有栖川に由来し、この駅の四条大宮方面ホームは右京区 嵯峨野有栖川町に位置しています。